嚴格意義上說，配方和染菌是沒有關系的，本文所指的是：因配方的不合理導致的間接性染菌。
配方有兩個重要指標：一是配方的營養(yǎng)構成，二是配方的物理構成，兩者不合理不會引起直接染菌，而是因為配方的物理構成和營養(yǎng)構成導致不能為菌絲生長提供最合適的生長條件，甚至導致菌絲在惡劣環(huán)境中生長，菌絲生長處于劣勢，生長緩慢，纖弱，雜菌乘虛而入。
合理的營養(yǎng)構成原則是：既要滿足菌絲和子實體生長的營養(yǎng)需求，又不能營養(yǎng)過于豐富，營養(yǎng)過于豐富的配方容易引起染菌，特別是非工廠化的栽培方式。
培養(yǎng)基的含水量和pH值是配方的重要部分，因為要根據(jù)目標含水量和pH值來確定和調整原材料的比例，含水量過高，或者是培養(yǎng)基含水能力差，都會增加細菌感染的機會。
對于pH值，要以菌絲生長的最合適pH值進行調節(jié)，單純的依靠提高pH值的方法抑制雜菌侵染是不可取的，過高的pH值反而使菌絲在不良的環(huán)境下生長，生長速度的質量都會下降，反而容易引起污染。
配方直接決定了培養(yǎng)基的物理構成，主要包括透氣性、含水性、液體菌種的滲透性等因素，這一點需要充分的了解每一種原材料的特性，進而調整比例，以使培養(yǎng)基的物理結構達到最佳狀態(tài)。
大多數(shù)食用菌栽培者重視配方是因為配方和產(chǎn)量的關系，而忽略了配方不合適導致的間接性染菌，希望本文能夠引起朋友們的重視。
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